La principale différence entre l'hyperconjugaison et la conjugaison backbonding réside dans leur formation de liaisons. Le backbonding est le mouvement des électrons d'une orbitale atomique sur un atome à une orbitale pi anti-liaison sur un ligand, tandis que l'hyperconjugaison est l'interaction de liaisons sigma avec un réseau pi et la conjugaison est le chevauchement des orbitales pi le long d'une liaison sigma.
Nous pouvons discuter des termes backbonding, hyperconjugation et conjugaison en référence aux différentes liaisons chimiques dans les composés. Les trois termes décrivent le chevauchement des orbitales électroniques autres que les principales liaisons covalentes de la molécule.