Différence clé - Ligature émoussée ou collante
Les endonucléases de restriction sont des enzymes spécifiques qui coupent l'ADN double brin (ADNdb). Ils sont également connus sous le nom de ciseaux moléculaires en biologie moléculaire. Les enzymes de restriction sont capables de reconnaître des séquences courtes spécifiques de l'ADNdb connu sous le nom de sites de reconnaissance et de cliver les liaisons phosphodiester et hydrogène pour ouvrir les doubles brins. En raison du clivage par ces enzymes, des fragments d'ADN sont produits avec différents types d'extrémités telles que des extrémités collantes et des extrémités franches. L'ADN ligase est une enzyme utilisée en biologie moléculaire pour joindre deux brins d'ADN adjacents en formant de nouvelles liaisons. L'étape est connue sous le nom de ligature et selon le type de l'extrémité d'ADN ligaturée, elles peuvent être appelées ligature d'extrémité franche et ligature d'extrémité collante. La principale différence entre la ligature des extrémités franches et collantes est que la ligature des extrémités franches se produit entre des fragments d'ADN qui contiennent deux extrémités franches, tandis que la ligature des extrémités collantes se produit entre les surplombs de 5 'et 3'. Comparée à la ligature des extrémités émoussées, la ligature des extrémités collantes est plus efficace et stable.
TABLE DES MATIÈRES
1. Présentation et différence clé
2. Qu'est-ce que la ligature des extrémités émoussées
3. Qu'est-ce que la ligature des extrémités collantes
4. Comparaison côte à côte - Ligation des extrémités émoussées et collantes
5. Résumé
Qu'est-ce qu'une ligature d'extrémité émoussée?
Certaines endonucléases de restriction peuvent couper l'ADN aux bases opposées et produire des fragments d'ADN à extrémités franches. Ces enzymes sont connues sous le nom de coupeurs à bouts francs; ils clivent directement jusqu'au milieu du site de restriction sans laisser de bases en surplomb simple brin. Les extrémités émoussées sont également connues sous le nom d'extrémités non en surplomb car elles n'ont pas de bases en surplomb de 3 'et 5' aux extrémités. Les deux brins se terminent à partir de paires de bases par des extrémités franches. Les enzymes de coupe à bouts francs courants sont EcoRV HaeIII, AluI et SmaI.
La ligature des extrémités émoussées est impliquée entre deux extrémités émoussées. Ce n'est pas une ligature de bases saillantes. Cette ligature est moins efficace que la ligature à extrémité collante. Cependant, dans certaines occasions, la ligature des extrémités franches devient plus avantageuse que la ligature des extrémités collantes, en particulier lors de la ligature des produits de PCR. Les produits PCR sont toujours fabriqués avec des extrémités franches. La ligature des extrémités franches ne nécessite pas d'extrémités complémentaires dans l'ADN pour la ligature.
Figure 01: Production d'extrémité émoussée par l'enzyme Eco RV
Qu'est-ce qu'une ligature Sticky End?
Certaines endonucléases de restriction sont capables de couper l'ADNdb, laissant un morceau d'ADN simple brin en surplomb à la fin. Ces extrémités sont appelées extrémités collantes ou en surplomb. La ligature des extrémités collantes se produit entre deux fragments d'ADN qui contiennent des surplombs correspondants parce que les extrémités collantes sont possédées par des bases non appariées et nécessitent des bases complémentaires pour former des liaisons. Par conséquent, il est nécessaire d'utiliser la même enzyme de restriction pour les deux sources d'ADN afin de produire les fragments de ligature correspondants.
La ligature des extrémités collantes est plus efficace et est souvent hautement souhaitable dans les processus de clonage. Il existe plusieurs enzymes de restriction qui produisent des extrémités collantes. Ce sont EcoRI, BamHI, HindIII etc.
Figure 02: Production d'extrémité collante par l'enzyme Eco RI
Quelle est la différence entre la ligature émoussée et collante?
Diff article au milieu avant la table
Ligature émoussée ou collante |
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| La ligature des extrémités franches se produit entre deux fragments d'ADN à extrémités franches. | La ligature des extrémités collantes se produit entre deux fragments d'ADN correspondants avec des extrémités collantes. |
| Les enzymes | |
| Les couteaux émoussés produisent des extrémités émoussées. | Les couteaux collants produisent des extrémités collantes ou cohésives. |
| Exigence d'appariement des extrémités | |
| Il ne nécessite pas de fragments correspondants ou de bases complémentaires. | Il nécessite des bases complémentaires aux extrémités pour former des paires de bases. |
| Efficacité | |
| Il est moins efficace que la ligature des extrémités collantes | Elle est plus efficace que la ligature des extrémités émoussées. |
Résumé - Ligature d'extrémité émoussée ou collante
Les endonucléases de restriction sont capables de cliver l'ADNdb et de produire des fragments d'ADN avec des extrémités différentes. Ils reconnaissent des séquences spécifiques et restreignent l'ADN en créant des extrémités collantes et émoussées. Les extrémités collantes ont des bases non appariées à la fin des fragments. Les extrémités émoussées sont créées en raison d'un clivage droit et ont des paires de bases aux extrémités. La ligature des extrémités collantes nécessite deux morceaux d'ADN simple brin complémentaires. La ligature d'extrémité émoussée se produit entre deux fragments d'extrémité émoussés quelconques. C'est la différence entre une ligature émoussée et collante.
