Le différence clé entre la configuration R et S est que la configuration R est la disposition spatiale de l'isomère R, qui a sa direction relative d'ordre de priorité dans le sens des aiguilles d'une montre, tandis que la configuration S est la disposition spatiale de l'isomère S qui a sa direction relative de priorité ordre dans le sens anti-horaire. Ici, la direction relative de l'ordre de priorité est l'ordre décroissant des priorités des substituants.
Les isomères R et S sont des molécules organiques ayant un centre chiral, qui est un atome de carbone auquel sont attachés quatre substituants différents. Ces substituants sont listés en fonction de leur priorité (la priorité est déterminée en utilisant les règles CIP comme décrit ci-dessous).