Le différence clé entre l'ovaire et l'ovule est que l'ovaire fait partie de la structure reproductrice féminine qui se développe en fruit de plantes à fleurs, tandis que l'ovule est une structure qui se développe en graine de plantes à graines.
La fleur est la structure reproductrice des plantes à fleurs. Certaines fleurs sont parfaites tandis que d'autres sont des fleurs imparfaites. Les fleurs parfaites contiennent à la fois les parties reproductrices mâles et femelles comme l'androcée et le gynécée respectivement. Le gynécée a trois composants principaux, à savoir la stigmatisation, le style et l'ovaire. En conséquence, l'ovaire est la structure qui contient les ovules. On peut le trouver à la base du gynécée. Ainsi, les ovules sont les structures qui portent les cellules reproductrices féminines ou les ovules. L'ovaire entoure les ovules en fleur. Un ovaire peut contenir plusieurs ovules, mais un ovule contient souvent un ovule (gamète femelle). Après la fécondation, l'ovaire et l'ovule se développent en différentes structures d'un fruit.