La principale différence entre le chromosome banding et la peinture chromosomique est que le chromosome banding est une technique de coloration qui affiche les régions des chromosomes dans des bandes sombres et claires distinctes, mais la peinture chromosomique est une technique d'hybridation dans laquelle des régions ou segments spécifiques de chromosomes sont peints avec des séquences spécifiques sondes marquées par fluorescence.
En cytogénétique, il est nécessaire de produire un caryotype visible d'un organisme afin d'identifier les chromosomes et leurs aberrations. Le bandage chromosomique et la peinture chromosomique sont deux techniques cytogénétiques qui aident à visualiser les chromosomes. Les deux techniques sont utiles pour identifier les troubles génétiques.