La principale différence entre le carré de Punnett et le pedigree est que le carré de Punnett affiche tous les génotypes possibles qui peuvent être hérités de deux génotypes parentaux, tandis que le pedigree représente l'histoire familiale d'un trait particulier, en particulier l'hérédité d'un gène.
Le carré de Punnett et le pedigree sont deux types d'outils qui aident à déterminer la probabilité d'hérédité des gènes. Les deux montrent la probabilité d'hériter d'un trait particulier à la progéniture. En d'autres termes, les deux prédisent les modèles d'héritage dans les lignées familiales. Par conséquent, ils peuvent aider à déterminer le risque de maladie héréditaire chez un enfant. Le carré de Punnett est simplement une manière graphique de montrer tous les génotypes possibles qui peuvent survenir chez les enfants des deux parents.