Le différence clé entre la physiopathologie et la pathogenèse est que la physiopathologie explique les conditions généralement observées au cours d'un état pathologique ainsi que les processus ou mécanismes opérant au sein d'un organisme tandis que la pathogenèse explique l'origine et le développement d'une maladie et si la maladie est aiguë, chronique ou récurrente.
La physiopathologie et la pathogenèse sont deux termes similaires utilisés pour expliquer l'apparition d'une maladie et les mécanismes et caractéristiques associés. La physiopathologie concerne les conditions observées lors d'un état pathologique et les processus en cours au sein d'un organisme. La pathogenèse se concentre principalement sur l'origine et le développement d'une maladie. Les deux études sont importantes pour diagnostiquer une maladie et prévenir sa propagation.
