La principale différence entre la génétique classique et moderne est que la génétique classique est la génétique mendélienne ou l'ancien concept de génétique, qui s'exprime uniquement sur la base des phénotypes résultant d'expériences de sélection, tandis que la génétique moderne est le nouveau concept de génétique, qui permet la recherche de génotypes avec phénotypes.
Le grand scientifique Gregor Mendel est le père de la génétique. Mendel a introduit plusieurs lois concernant l'héritage des traits et la manière dont les traits passent du parent à la progéniture. Ainsi, ses découvertes sont devenues la base du tout nouveau concept découvert plus tard en génétique. Par conséquent, la génétique classique et la génétique moderne sont deux concepts distincts. Cependant, la génétique classique est la base de la génétique moderne.